視覺(jué)中國(guó)供圖
“一騎紅塵妃子笑,,無(wú)人知是荔枝來(lái)。”千百年來(lái),荔枝都是備受人們喜愛(ài)的佳果,。而它究竟是不是土生土長(zhǎng)的“中國(guó)果”?我國(guó)科學(xué)家花了整整12年時(shí)間解碼荔枝基因組,,最近終于揭開其起源馴化面紗,,找到荔枝起源于中國(guó)云南的有力證據(jù)。
集萬(wàn)千寵愛(ài)于一身的荔枝佳果,,在我國(guó)的栽培記錄可追溯到2300多年前,。它的美味讓無(wú)數(shù)人為之傾倒。
可是,,圍繞荔枝也有不少爭(zhēng)議:有人說(shuō)它的出生地并非在中國(guó)云南,;農(nóng)戶嫌它大小年結(jié)果現(xiàn)象突出,導(dǎo)致供應(yīng)鏈不穩(wěn),;科學(xué)家說(shuō)它缺乏基因組序列信息,,制約基礎(chǔ)研究的深度。
“相比于柑橘,、蘋果,、桃等其他大宗水果,,荔枝在基礎(chǔ)研究水平上的差距較大,,且育種技術(shù)落后。破譯荔枝基因組密碼,,對(duì)開發(fā)新的育種技術(shù),,促進(jìn)基礎(chǔ)研究具有重要作用?!毖芯咳藛T表示,。
12年前,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院研究員李建國(guó)所在的科研團(tuán)隊(duì)決定破譯荔枝基因組密碼,揭開其起源馴化面紗,?!霸跊](méi)有基因組的時(shí)代,哪個(gè)地方生長(zhǎng)有野生荔枝,,它可能就被認(rèn)為是起源中心,。最初在我國(guó)南部發(fā)現(xiàn)了野生荔枝,可后來(lái)在越南也發(fā)現(xiàn)有野生荔枝,,究竟哪里才是荔枝真正的出生地呢,?”李建國(guó)說(shuō)。
科研團(tuán)隊(duì)從眾多荔枝中挑選出妃子笑作為研究對(duì)象,,“因?yàn)樗俏覈?guó)栽培范圍最廣,、產(chǎn)量最高、鮮果銷售期最長(zhǎng)的一個(gè)主栽品種,?!毖芯咳藛T說(shuō)。研究中,,科研團(tuán)隊(duì)利用二代Illumina,、三代PacBio、Hi-C和10XGenomics等最新的基因組測(cè)序數(shù)據(jù),,通過(guò)優(yōu)化基因組組裝策略,,完成妃子笑荔枝基因組假染色體水平的組裝。
“令我們想不到的是,,妃子笑基因組的雜合度高達(dá)2.27%,,這在植物中非常少見。雜合度高為項(xiàng)目前期的基因組組裝帶來(lái)了很大的挑戰(zhàn),?!比A南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院院長(zhǎng)胡桂兵感嘆道。
最終,,科研團(tuán)隊(duì)利用72份荔枝資源重測(cè)序數(shù)據(jù),,鑒定到高質(zhì)量的SNPs位點(diǎn),提出了荔枝“一個(gè)起源中心,、兩個(gè)獨(dú)立馴化事件”假說(shuō),。
“云南是野生荔枝的起源中心,它沿著西江傳播,,在海南形成野生荔枝種群的一個(gè)主要棲息地,;此后,云南和海南野生荔枝分別獨(dú)立馴化為特早熟和晚熟品種,,特早熟品種和晚熟品種再進(jìn)一步雜交形成早熟與中熟品種,?!崩罱▏?guó)打趣道,“我們發(fā)現(xiàn)妃子笑中的兩個(gè)單倍體基因組,,一個(gè)和云南野生荔枝是一家人,,另一個(gè)和海南野生荔枝是一家人?!?/p>
葉青 陳芃辰