2020年11月9日,,國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化組織生物技術(shù)委員會(huì)正式發(fā)布微生物資源中心數(shù)據(jù)管理和數(shù)據(jù)規(guī)范,,這是國(guó)際微生物領(lǐng)域的第一個(gè)ISO級(jí)別的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),也是我國(guó)在國(guó)際生物技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)委員會(huì)主導(dǎo)制定的第一個(gè)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn),。
近日,,海外蔓延的新冠肺炎病毒毒株顯示了多重變異的特性。針對(duì)來(lái)源不同的樣本,,我國(guó)科學(xué)家利用基因測(cè)序精確跟蹤出病毒變異的特征,。
認(rèn)識(shí)、追蹤,、應(yīng)對(duì)新冠病毒,,與人類對(duì)新冠病毒的首次認(rèn)知息息相關(guān)。
在疫情初期,,我國(guó)科學(xué)家在首次獲取新冠病毒樣本幾天后,,便實(shí)現(xiàn)了對(duì)這種全新病毒的分離、測(cè)序工作,,于2020年1月11日向世界衛(wèi)生組織和各國(guó)分享了新冠病毒的全基因序列,。隨后,國(guó)家病原微生物資源庫(kù)和國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心聯(lián)合開(kāi)發(fā)的“新型冠狀病毒國(guó)家科技資源服務(wù)系統(tǒng)”,,將人類首次從分子層面精確認(rèn)知病原體的時(shí)間大大縮短,。1月24日,兩機(jī)構(gòu)又聯(lián)合發(fā)布了新冠病毒PCR試劑探針引物序列,、新冠病毒電子顯微鏡照片,。這些信息的廣泛共享為全世界科研人員開(kāi)發(fā)快速分子檢測(cè)方法、設(shè)計(jì)分子靶向藥物和研發(fā)新冠肺炎疫苗提供了指導(dǎo),。
時(shí)至今日,,這些信息仍服務(wù)于全世界新冠病毒的重要研究,支撐著后續(xù)的抗疫工作,。
直面困難,,果敢出擊,在迎戰(zhàn)新冠肺炎疫情的關(guān)鍵時(shí)刻,,包括國(guó)家病原微生物資源庫(kù),、國(guó)家非人靈長(zhǎng)類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物資源庫(kù)、國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心在內(nèi)的國(guó)家平臺(tái)以保衛(wèi)人民健康為己任,,第一時(shí)間向全球科學(xué)家分享了病毒的相關(guān)信息等,。
國(guó)家資源庫(kù)和國(guó)家科學(xué)數(shù)據(jù)中心攜手合作,發(fā)揮協(xié)同作用,,面向國(guó)家重大需求,、面向人民生命健康,,展現(xiàn)出科技創(chuàng)新資源的“基石”作用。
國(guó)家非人靈長(zhǎng)類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物資源庫(kù)更是在動(dòng)物模型建立方面領(lǐng)先國(guó)際,,成功建立了獼猴,、食蟹猴、狨猴,、樹(shù)鼩新冠肺炎模型,,在新冠肺炎疫苗、動(dòng)物模型和藥物篩選研究中發(fā)揮了重要作用,,參與新冠肺炎疫苗評(píng)價(jià)26項(xiàng),,篩選候選藥物及抗體6個(gè),為全國(guó)40余家科研院所,、大學(xué),、企業(yè)提供非人靈長(zhǎng)類動(dòng)物資源和技術(shù)服務(wù)。
國(guó)家病原微生物資源庫(kù):
不斷豐富人類對(duì)病原的認(rèn)知
2021年1月,,為應(yīng)對(duì)新冠病毒的頻繁變異,,國(guó)家病原微生物資源庫(kù)(以下簡(jiǎn)稱病原庫(kù))將接收并保藏的由廣東省疾控中心分離到的501Y.V2南非突變株,共享給中國(guó)疾控中心病毒病所,、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院,、中國(guó)科學(xué)院及國(guó)家病毒資源庫(kù)和國(guó)家人類疾病動(dòng)物模型資源庫(kù)等,為迅速啟動(dòng)全國(guó)科研聯(lián)合攻關(guān),,評(píng)價(jià)現(xiàn)有診斷試劑,、疫苗研發(fā)、動(dòng)物模型和調(diào)整疫情防控策略提供了支撐,。
毫不夸張地說(shuō),,人類對(duì)于病原微生物的認(rèn)知深度,取決于病原庫(kù)的保有量,,它已成為人類對(duì)病原認(rèn)知的“家底”,。
2020年,病原庫(kù)制定新冠病毒保藏接收與審批流程,,接收來(lái)自全國(guó)新冠病毒毒株保藏申請(qǐng),,截至2020年12月底,已有11家單位提出保藏申請(qǐng),,共158株新冠病毒毒株被納入國(guó)家保藏中心統(tǒng)一管理,,同時(shí)對(duì)外開(kāi)展共享。
此外,,在保障新冠肺炎疫苗研發(fā)方面,病原庫(kù)還提供毒種第三方檢測(cè)服務(wù)工作,,為10家被檢測(cè)單位進(jìn)行毒種檢測(cè),;為2家疫苗公司提供主種子批,、工作種子批毒種制備;為科研單位提供滅活的毒株作為標(biāo)準(zhǔn)品,,進(jìn)行試劑盒評(píng)價(jià),,提供新冠病毒毒株用于新冠肺炎疫情防控、動(dòng)物模型建立,、藥物評(píng)價(jià)和疫苗研發(fā)等科學(xué)研究,。
國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心:
在微生物大數(shù)據(jù)領(lǐng)域引領(lǐng)全球
2020年2月18日,國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心(以下簡(jiǎn)稱數(shù)據(jù)中心)發(fā)布“全球冠狀病毒組學(xué)數(shù)據(jù)共享與分析系統(tǒng)”,,首次整合包括此次新冠病毒基因組數(shù)據(jù)在內(nèi)的全球冠狀病毒基因組11504個(gè),,核酸序列46245條,為科學(xué)家進(jìn)行分析研究提供了重要的支撐和保障,,并促進(jìn)國(guó)內(nèi)外冠狀病毒數(shù)據(jù)匯集與綜合分析及共享,。
2020年2月20日,中國(guó)科學(xué)院微生物所齊建勛研究員團(tuán)隊(duì)完成了新冠病毒S蛋白結(jié)構(gòu)解析,,在文章發(fā)表前第一時(shí)間將結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)上傳到了國(guó)際蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)(PDB)和數(shù)據(jù)中心,,6個(gè)小時(shí)后數(shù)據(jù)中心網(wǎng)站上線并供全球科學(xué)家下載,國(guó)際PDB于2020年3月18日提供共享,。
數(shù)據(jù)中心在支撐禽流感,、埃博拉、寨卡病毒的暴發(fā)研究中也持續(xù)提供最新數(shù)據(jù)的支持,,在食品安全,、公共衛(wèi)生、疾病防御等多個(gè)領(lǐng)域提供數(shù)據(jù)和服務(wù),,持續(xù)為重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃,、科技基礎(chǔ)資源調(diào)查專項(xiàng)等提供數(shù)據(jù)匯交和共享服務(wù),目前已經(jīng)承擔(dān)了“生物安全關(guān)鍵技術(shù)”“公共安全風(fēng)險(xiǎn)防控與應(yīng)急技術(shù)”等專項(xiàng)超過(guò)130個(gè)機(jī)構(gòu)200個(gè)項(xiàng)目的數(shù)據(jù)匯交,,在生物安全與病原微生物領(lǐng)域可共享數(shù)據(jù)集超過(guò)12000個(gè),,數(shù)據(jù)量超過(guò)3PB。
作為世界微生物數(shù)據(jù)中心的承擔(dān)單位,,國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心在國(guó)際交流與合作方面具有良好的基礎(chǔ),,逐步在微生物大數(shù)據(jù)領(lǐng)域的國(guó)際合作方面占據(jù)了全球領(lǐng)先的地位。2020年11月9日,,國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化組織生物技術(shù)委員會(huì)正式發(fā)布微生物資源中心數(shù)據(jù)管理和數(shù)據(jù)規(guī)范,,這是國(guó)際微生物領(lǐng)域的第一個(gè)ISO級(jí)別的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),也是我國(guó)在國(guó)際生物技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)委員會(huì)主導(dǎo)制定的第一個(gè)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn),。該中心與國(guó)家病原微生物資源庫(kù)合作牽頭組織的國(guó)家自然科學(xué)基金委重大國(guó)際合作項(xiàng)目與俄羅斯聯(lián)邦基礎(chǔ)與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心,、巴西FIOCRUZ基金會(huì)奧斯瓦爾多·克魯茲研究所、印度海德拉巴賈瓦哈拉爾·尼赫魯科技大學(xué)等金磚國(guó)家主要機(jī)構(gòu)開(kāi)展了持續(xù)的合作,,在新冠病毒的傳播機(jī)制和流行病學(xué)研究方面,,取得了重要的成果,。
中國(guó)科學(xué)院院士、國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心專家組組長(zhǎng)高福在此前召開(kāi)的香山科學(xué)會(huì)議上曾表示,,現(xiàn)今信息,、統(tǒng)計(jì)學(xué)和生物技術(shù)高速發(fā)展,病原微生物及其導(dǎo)致疾病的信息產(chǎn)生了海量數(shù)據(jù),,如何采集,、篩檢、存儲(chǔ),、管理和分析挖掘這些信息,,并解決傳染病防控的具體工作,是新的科學(xué)問(wèn)題,。古老的現(xiàn)場(chǎng)調(diào)查數(shù)據(jù)揭示了傳染病傳播的三大重要環(huán)節(jié),,奠定了傳染病防控的基本思路和基礎(chǔ),并促進(jìn)了流行病學(xué)學(xué)科的發(fā)展,。如今的現(xiàn)場(chǎng)調(diào)查數(shù)據(jù)借助信息技術(shù)突破了地域和規(guī)模的限制,,在展示、綜合和分析方面日趨便利,,篩檢有用的數(shù)據(jù)并采用合理的分析模型和統(tǒng)計(jì)學(xué)方法,,才能為傳染病防控提供有效的方案。
國(guó)家非人靈長(zhǎng)類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物資源庫(kù):
人類有效應(yīng)對(duì)疾病的“突破口”
數(shù)據(jù)顯示,,2020年,,國(guó)家非人靈長(zhǎng)類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物資源庫(kù)(以下簡(jiǎn)稱資源庫(kù))通過(guò)非人靈長(zhǎng)類和樹(shù)鼩資源保障及技術(shù)支持,為新冠實(shí)驗(yàn)提供了實(shí)驗(yàn)猴761只,,技術(shù)服務(wù)20440余人次,,在新冠肺炎疫苗、動(dòng)物模型和藥物篩選研究中發(fā)揮了重要作用,,其中評(píng)價(jià)新冠肺炎疫苗26項(xiàng),,有7個(gè)正在臨床試驗(yàn),2個(gè)已上市,;篩選候選藥物及抗體6個(gè),。
非人靈長(zhǎng)類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物是新冠肺炎疫苗等研究必不可少的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物。作為資源庫(kù)的依托單位,,中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所全力支持和保障,,為新冠肺炎疫苗評(píng)價(jià)、動(dòng)物模型,、候選藥物篩選等作出了重要貢獻(xiàn),,在支撐新冠肺炎疫情防控、核酸檢測(cè)試劑盒研發(fā),、新冠肺炎疫苗評(píng)價(jià),、動(dòng)物模型構(gòu)建等方面起到了不可替代的作用,。
此外,在服務(wù)腦科學(xué)計(jì)劃方面,,資源庫(kù)提供了腦脊液、骨髓,、血液,、組織、細(xì)胞等樣品2000余份,,為全國(guó)科研機(jī)構(gòu),、大學(xué)、醫(yī)院,、企業(yè)等開(kāi)展40余項(xiàng)技術(shù)服務(wù)項(xiàng)目,,同時(shí)建立了“國(guó)家非人靈長(zhǎng)類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物資源庫(kù)”線上系統(tǒng)和“模型—評(píng)價(jià)”資源數(shù)據(jù)庫(kù),逐步實(shí)現(xiàn)了資源庫(kù)的“數(shù)字孿生”,。